Ketika X-Men mendirikan Krakoa, itu menandai bab baru yang secara mendasar mengubah status quo Marvel Comics. Mutan di mana-mana akhirnya muak dengan penganiayaan manusia dan berupaya membangun komunitas mereka sendiri di mana mereka bisa mengatur diri sendiri. Pendirian Krakoa adalah perubahan tempo yang menyambut bagi para penggemar X-Men, memberi mutan kesempatan untuk berkembang dalam cara yang sebelumnya tidak mungkin. Namun retakan pada utopia mutan ini mulai terlihat hampir segera. Dan meskipun banyak pembaca masih mengingat Zaman Krakoa dengan hangat, hal itu pada akhirnya menyebabkan kerusakan yang tidak dapat diperbaiki pada merek X-Men dengan membuat mereka membuang hampir seluruh kredibilitas moral mereka dalam membangun negara mutan-saja yang baru.
Selama beberapa dekade, X-Men telah menjadi pahlawan yang melindungi orang tak bersalah, mutan maupun manusia. Namun Krakoa mengubah segalanya dengan menunjukkan apa yang terjadi ketika para pahlawan ini bebas menentukan jalan mereka sendiri dan membangun negara serta pemerintah mereka sendiri. Dan seperti kebanyakan pemerintahan dan utopia yang dijanjikan, negara X-Men dengan cepat berkembang menjadi tempat konspirasi dan korupsi yang pada akhirnya merugikan mereka segala-galanya dan mengubah mereka menjadi penjahat.
5) “Buat Lebih Banyak Mutan”
Tak rahasia lagi bahwa mutan sering menjadi korban genosida massal yang secara signifikan mengurangi jumlah mereka yang sudah kecil. Krakoa berupaya memperbaiki hal itu dengan hukum pertamanya: Buat Lebih Banyak Mutan. Warga Krakoa didorong untuk berkembang biak untuk meningkatkan populasi mutan, dengan kontrasepsi sangat tidak dianjurkan. Hukum ini memiliki paralel yang mengkhawatirkan dengan program pembiakan eugenik dunia nyata yang telah terjadi sepanjang sejarah, dan jelas X-Men tidak terlalu memikirkan apa pun selain membuat bayi mutan lebih banyak. Seperti yang diungkapkan Stacy X kepada Nightcrawler, hukum itu berarti banyak bayi mutan ditelantarkan oleh orang tua mereka yang belum siap dengan tanggung jawab. Lebih buruk lagi, mutan telepatis Third Eye ditangkap karena tindakan menunjukkan kepada orang-orang bahwa konsekuensi dari terus-menerus berkembang biak akan menyebabkan banyak anak yang ditinggalkan. Semua ini diperparah oleh fakta bahwa Krakoa bahkan tidak mendirikan layanan adopsi. Dalam tergesa-gesa membangun masa depan bagi mutan, X-Men lupa membangun sebuah struktur untuk melindungi mutan-mutan yang akan mewarisinya.
4) Penjahat di Dewan Sunyi

Saat mengembangkan negara mutan pertama yang dipimpin, banyak pemikiran dan kehati-hatian yang ditempatkan pada siapa yang akan membentuk badan pemerintahan, Dewan Sunyi. Meskipun Dewan Sunyi mencakup banyak pahlawan, anggota lainnya adalah beberapa penjahat terbesar X-Men. Penjahat super seperti Apocalypse, Mystique, Exodus, Sebastian Shaw, dan Mr. Sinister menempati kursi tertinggi dalam pemerintahan Krakoa dengan janji bahwa mereka akan mengikuti hukum. X-Men memberi mereka posisi ini karena mereka melihat pengetahuan mereka sangat berharga bagi kemakmuran Krakoa. Meskipun beberapa dari penjahat ini, seperti Apocalypse dan Exodus, memanfaatkan kesempatan itu untuk menjalani arc penebusan yang signifikan, yang lain terbukti menjadi pilihan yang buruk. Tak mengherankan, Mr. Sinister menggunakan akses barunya ke DNA setiap mutan untuk mencoba mengambil alih dunia. Sementara itu, Sebastian Shaw terus menusuk rekan-rekan anggota Dewan dari belakang untuk memperoleh kekuasaan lebih. Keanggotaan Dewan Sunyi menunjukkan kompromi moral yang bersedia dilakukan X-Men demi Krakoa.
3) Diskriminasi Manusia

Profesor X menciptakan X-Men untuk memperjuangkan masa depan di mana mutan dan manusia bisa hidup berdampingan dalam koeksistensi. Krakoa membunuh impian itu, karena X-Men meninggalkan koeksistensi untuk isolasi. Dan seperti negara etnos, negara mutan Krakoa dengan cepat mulai menyimpang menjadi negara yang membanggakan keunggulan mutan. Manusia dilarang masuk Krakoa tanpa ada mutan yang membela mereka, dan meskipun begitu, mereka tetap sering diperlakukan tidak adil. X-Men mencoba meyakinkan Franklin Richards untuk meninggalkan keluarganya yang manusia karena mereka pikir dia adalah mutan. Diskriminasi manusia Krakoa juga meluas melampaui batasnya, seperti ketika mereka menyatakan semua mutan di Bumi memiliki kekebalan diplomatik karena X-Genes mereka. Ini bahkan membuat Emma Frost mengancam akan membunuh seluruh ruang sidang di Amerika jika mereka tidak segera membebaskan pembunuh berantai Sabretooth. Para pemimpin Krakoa juga mulai memuja keunggulan mereka atas manusia lainnya, dan dalam beberapa kasus drastis, menggunakan telepati Profesor X dan Emma Frost untuk membujuk para pemimpin dunia agar mendukung mereka. Krakoa pada dasarnya membenarkan ketakutan umat manusia terhadap mutan.
2) Lubang Pengasingan

Krakoa mungkin telah dijadikan tempat perlindungan bagi mutan, tetapi X-Men tahu mereka membutuhkan penjara untuk para penjahat paling berbahaya. Lubang Pengasingan berada di dalam perut Krakoa sebagai sistem penjara rahasia bagi mereka yang dituduh melanggar hukum paling fundamental negara tersebut. Mereka yang dipenjara terjerat dalam sulur Krakoa dan ditempatkan dalam keadaan penyiksaan sensorik dan fisik. Ketika Krakoa mengirim Sabretooth dalam misi yang menewaskan orang tak bersalah, mereka menahannya dari yurisdiksi Amerika sehingga bisa memenjarakannya di Lubang Pengasingan. Jadi pada dasarnya, Dewan Sunyi memenjarakan Sabretooth karena melakukan pekerjaan kotor mereka. Contoh paling mencolok adalah ketika Profesor X dan Magneto mengadakan sebuah pengadilan kanguru rahasia yang menghukum Third Eye ke Lubang Pengasingan karena mempromosikan struktur keluarga yang stabil alih-alih berproliferasi liar untuk mencegah anak mutan baru yang ditinggalkan. Sifat sebuah penjara rahasia yang mengirim orang ke penjara tanpa perwakilan hukum atau proses yang adil menunjukkan betapa distopia Krakoa telah menjadi.
1) Genosida Terra Verde

Tidak ada X-Man yang mengalami penurunan kemuliaan menjadi penjahat yang lebih brutal selama Zaman Krakoa selain Beast. Dahulu ia adalah sahabat timnya, ilmuwan brilian, Beast menjadi kepala versi Krakoa dari CIA: X-Force. Krakoa pernah mencoba berunding dengan negara kecil Amerika Selatan Terra Verde, tetapi putra presiden, Hadwin Cocom, campur tangan. Cocom ditingkatkan dengan bioteknologi mutakhir, telefronics, yang diyakini Beast bisa mengancam monopoli Krakoa atas obat dunia. Untuk menghadapi ancaman yang diduga, Beast melobotomisasi Hadwin, yang secara tidak langsung membuat telefronics di tubuhnya menjadi liar. Tak lama kemudian, telefronics merajalela Terra Verde dan menelan hampir seluruh populasi, membunuh ribuan, jika bukan jutaan orang. Beast kemudian menutupi apa yang telah dilakukannya terhadap Terra Verde dan menjadikannya negara boneka miliknya sendiri. Kurang dari setahun sejak didirikannya, salah satu tokoh Krakoa yang paling berpengaruh melakukan genosida literal. Krakoa mungkin telah mengklaim didirikan untuk melestarikan mutan, tetapi ia menjadi mimpi buruk distopia yang dibangun di atas darah orang-orang yang tidak bersalah.